Анализ кала выявляет 90 процентов случаев рака толстой кишки без колоноскопии

Второй по смертности вид рака в мире теперь можно обнаружить с помощью образца кала и алгоритма. Исследователи Женевского университета разработали тест, который выявляет 90 процентов случаев колоректального рака — без колоноскопии, без седации и без визита в больницу. Метод основан на считывании скрытых сигналов в кишечных бактериях с точностью, которой ни один диагностический инструмент прежде не достигал.

Колоректальный рак ежегодно уносит жизни более 900 000 человек во всём мире. При раннем выявлении выживаемость превышает 90 процентов. Проблема всегда была в колоноскопии — дорогостоящей, неприятной и требующей целого дня подготовки, из-за чего миллионы людей по всему миру раз за разом откладывают обследование. Это промедление нередко становится разницей между излечимым диагнозом и смертельным.

Кишечные бактерии, изученные до уровня подвида

Женевская команда подошла к проблеме с принципиально иной стороны. Вместо прямого исследования толстой кишки учёные составили карту кишечного микробиома с беспрецедентной детализацией — вплоть до подвида каждого бактериального штамма. Разные подвиды одной и той же бактерии могут оказывать прямо противоположное действие: одни способствуют росту опухоли, другие нейтральны. Прежние тесты анализировали лишь уровень вида и полностью пропускали этот сигнал.

Модель машинного обучения, обученная на этом каталоге бактерий на уровне подвидов, считывает стандартный образец кала и предсказывает наличие колоректального рака с точностью 90 процентов. Колоноскопия достигает 94 процентов. Все существующие неинвазивные методы уступают обоим — лучшие из действующих альтернатив дают от 70 до 80 процентов выявляемости.

Особенно значимо для молодых людей

Последствия для общественного здравоохранения выходят далеко за рамки этой цифры. Простой и недорогой анализ кала с точностью, близкой к колоноскопии, способен кардинально повысить охват скрининга — особенно среди молодых взрослых, у которых заболеваемость колоректальным раком растёт по неизвестным причинам, и среди населения, для которого колоноскопия фактически недоступна из-за стоимости и инфраструктурных ограничений.

Тест пока не введён в клиническую практику. Исследователи признают важное ограничение: выявление предраковых поражений — запущенных аденом, ещё не ставших злокачественными, — по-прежнему представляет большую сложность, чем обнаружение уже сформировавшихся опухолей. Это общая проблема всех существующих методов на основе анализа кала. Эффективность модели в генетически и географически разнородных популяциях предстоит оценить в готовящемся клиническом исследовании.

Клиническое исследование совместно с Женевскими университетскими больницами

Клиническое исследование в партнёрстве с Женевскими университетскими больницами готовится к запуску — оно позволит определить, на каких стадиях рака и при каких типах поражений метод работает наиболее эффективно. Если результаты подтвердят точность модели в разнородных популяциях, тест может стать инструментом скрининга первой линии, а колоноскопия будет назначаться только пациентам с положительным результатом. Исследование опубликовано в Cell Host & Microbe.