В японской ДНК скрывался третий предок, и он рушит историю о двух истоках

Жители Японии происходят не от двух предковых групп, как пишут в учебниках, а от трёх. Исследование, прочитавшее полные геномы 3256 человек по всей стране, нашло отдельную третью линию, наиболее заметную на северо-востоке, которую прежние модели свернули. Открытие переписывает историю происхождения народа и связывает нити того древнего смешения с болезнями, которые люди несут сегодня.

Старая картина была аккуратной. Она гласила, что современное японское происхождение идёт от дзёмон — охотников-собирателей, тысячелетиями живших на островах, — и от более поздних переселенцев из континентальной Восточной Азии, принёсших рисоводство. Два источника, проведённые начисто.

Геномы не укладываются в две ячейки. Сигнал дзёмон по-прежнему здесь и сильнее всего на Окинаве, где даёт примерно треть местного происхождения. Континентальный сигнал преобладает на западе Японии и ясно связан с ханьскими китайскими популяциями. Но третий компонент стоит особняком на северо-востоке, где жили исторические эмиси, и не сводится ни к одному из двух других.

Решающим стало чтение целых геномов, а не разрозненных маркеров. Команда секвенировала каждую букву 3256 геномов из национального медицинского биобанка и собрала их в базу данных, призванную картировать сразу и происхождение, и здоровье. При таком разрешении третья нить перестаёт выглядеть шумом и начинает походить на отдельную популяцию.

Глубокое прошлое оказывается ещё и медицинским. Анализ отметил 44 участка архаичной ДНК, унаследованной от неандертальцев и денисовцев. Сегмент денисовского происхождения возле гена NKX6-1 связан с диабетом 2-го типа и, возможно, влияет на отклик пациентов на препарат семаглутид, тогда как одиннадцать неандертальских участков идут рука об руку с ишемической болезнью сердца, раком простаты и ревматоидным артритом.

Деление на три — крепкий статистический вывод, а не родословная. Доли происхождения восстанавливают по закономерностям во множестве геномов, а северо-восточную нить описывают как родственную эмиси, а не как доказательство, что это и есть эмиси. К тому же образцы взяты из медицинского биобанка, который тяготеет к тем, кто в него записывается, поэтому точный баланс трёх источников следует читать как наилучшую оценку, а не окончательный счёт.

Работа под руководством Тикаси Тэрао из Центра интегративных медицинских наук RIKEN вышла в Science Advances в 2024 году и вновь привлекла внимание в этом месяце, когда стоящая за ней база геномных данных, известная как JEWEL, расширилась. Тот же подход теперь обращают к другим народам, давно описываемым через две части, в ожидании, что всё больше этих аккуратных историй окажутся прошиты третьей нитью.